买新房子进行公证主要是为了保护买卖双方的权益，避免不必要的经济财产纠纷，并确保房产交易的真实性和合法性。以下是具体的理由：
保护权益
房产公证能够保护购房者的利益，特别是在产权争夺时，经过公证的房屋协议或合同可以向法院申请权益保护，维护房屋产权拥有者的权益。
避免纠纷
经过公证的房子能够避免很多风险，因为公证处依法开出的证明具有法律效力，能够减少房屋交易过程中出现纠纷的可能性。
确保真实性和合法性
房产公证可以确保房产交易行为的真实性和合法性，避免因重大误解或欺诈行为导致的非真实意思表示，从而保护交易双方的合法权益。
提供法律证据
公证可以作为贷款的法律证据效力，银行通常要求购房者提供公证材料，以证明房产的真实性和合法性，从而降低贷款风险。
规范法律行为
将公证纳入房产管理活动体系，使公证成为房产交易的必经程序，有助于规范涉及房产的法律行为，预防房产纠纷，减少诉讼。
处理复杂关系
在购房过程中，公证可以提供必要的法律服务，处理好买卖双方、银行及中介机构的关系，确保合同的有效执行。
综上所述，买新房子进行公证不仅能够保护买卖双方的权益，还能确保房产交易的真实性和合法性，减少纠纷，并为贷款提供法律上的证据效力。因此，建议在购买新房时进行公证，以保障自身权益。