物流公司主要应交的税费包括以下几项：
增值税
陆路（含铁路）运输、水路运输、航空运输和管道运输服务，一般纳税人税率为11%，小规模纳税人税率为3%。
仓储、配送及货运代理等物流辅助服务，一般纳税人税率为6%，小规模纳税人税率为3%。
城建税
市区税率为7%。
县、镇税率为5%。
其他地区税率为1%。
教育费附加
税率为3%。
地方教育费附加
税率为2%。
所得税
基本税率为25%。
小型微利企业减按20%征收。
国家重点扶持的高新技术企业减按15%征收。
其他税种
房产税、土地使用税、印花税、车船税等。
堤围费或水利基金，按销售收入的0.1%缴纳。
个人所得税，按实际的应税所得和适用税率来计算，独资或合伙企业适用20%的税率，公司制企业适用25%的税率。
建议：
物流公司应详细咨询当地税务部门，了解最新的税收政策和税率，确保合法合规经营并优化税务筹划。