养殖公司资质主要包括以下几项：
动物防疫条件合格证：
这是办理工商营业执照的前置条件，规定动物饲养场、养殖小区等场所需要达到的条件，包括选址、布局、设施设备等。
野生动物驯养繁殖许可证：
对于驯养繁殖可人工养殖的野生动物，需要办理此证件。
动物检疫合格证明：
如果涉及动物养殖、屠宰或销售，需要申请动物检疫合格证。
工商营业执照：
是合法经营的基本凭证，开展业务的前提条件。
税务登记证：
持有税务登记证意味着公司具备合法纳税的资格。
排污许可证：
在建设养殖场时需要办理，根据实际情况来看。
养殖证：
国家要求海域水产养殖和内陆水域养殖户需要办理的证件。
备案登记证：
无论个人还是经营主体，兴建畜禽养殖场、养殖小区等，都需要向所在地的县级农业行政主管部门申请备案。
土地使用协议和环保手续：
需要办理生产设施用地的备案手续，签订用地协议并在国土局和农业局备案，同时需要配套建设污染防治设施，环评手续需到环保局办理。
其他特定资质：
根据农业有限公司所从事的具体业务和地区要求，可能还需要申请其他特定的资质和证明文件。
建议养殖公司在申请资质时，详细了解当地的具体要求和流程，确保所有证件齐全，以便顺利运营。