深圳实施限行措施的主要原因包括：
交通拥堵：
深圳是中国广东省的一个大城市，人口众多，车辆拥有量也非常大。随着城市的发展和人口的增加，交通拥堵问题日益严重，给城市的可持续发展带来了很大的压力。通过限制外地车辆的进入，可以减少道路拥堵情况，改善交通状况。
环境保护：
深圳市也面临着环境污染和空气质量下降的问题。由于汽车尾气排放是主要的空气污染源之一，限制外地车辆的进入可以减少尾气排放量，改善城市空气质量，保护环境。
大气污染防治：
深圳作为我国重要的一线城市之一，吸引了大量外地人前来，给当地交通带来巨大压力。限行措施可以强化大气污染防治的工作要求，控制机动车出行需求，缓解道路交通拥堵。
疫情防控：
在疫情防控期内，实施限行可以将外地牌照司乘人员“挤到”地铁等公共交通工具上去，不利于疫情防控。
城市规划和需求调控：
新一轮的城市建设高潮主要集中于原特区外地区，亟需从需求端入手前瞻性调控全市交通需求。
综合以上几点，深圳实施限行措施主要是为了缓解交通拥堵、保护环境和大气污染防治，同时也有助于疫情防控和城市交通需求的调控。