处理员工长期病假应遵循以下步骤和原则：
核实病情真实性
定期探望员工，了解其病情及恢复情况。
获取员工的主治医生联系方式，或直接联系其就诊医院以核实病情。
遵守公司规章制度
若病假不真实，视为旷工，按照单位规章制度处理。
若病假真实，但员工未在规定的医疗期内，可以提前30日通知解除劳动合同，或支付一个月工资作为代通知金，并支付经济补偿金。
关注员工权益
在医疗期内，公司应按规定支付病假工资，不得低于当地最低工资标准的80%。
与员工保持沟通，了解其康复情况，并在其康复后安排返岗工作。
合理安排工作
若员工病假时间过长，可以协商调整工作安排或进行远程办公，以减少对团队工作的影响。
建议员工在病情允许的情况下，适当进行康复治疗或休息。
法律依据
依据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业应给予员工一定的医疗期，并在医疗期内支付病假工资。
在处理过程中，企业要遵循相关法律法规，确保合法合规。
记录与跟进
统计医疗期是否经过，详细记录员工的病休天数，并在医疗期计算周期内进行汇总。
在员工医疗期届满且未能返岗时，发送医疗期满通知书，并安排劳动能力鉴定。
通过以上步骤，企业可以在确保员工权益的同时，维护公司的正常运转和利益。